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細菌送樣有哪些要求?

發(fā)表時間:2020-05-15 13:12


  隨著高通量測序技術和生物信息學的快速發(fā)展,細菌全基因組de novo測序已然成為一種探究細菌生物學問題的高性價比方法。通過全基因組測序,可以獲知待測菌株的基因及相關調(diào)控信息,為研究該菌株特有的生物學特征(致病機制,共生機制,獨有的代謝機制)提供分子生物學基礎;通過比較基因組分析,為研究菌株種內(nèi)及種間的功能差異、進化關系提供理論指導。

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樣品類型:菌體

送樣要求:菌體不宜培養(yǎng)時間過長,以對數(shù)生長中期細胞**;

樣品量:掃描圖≥3O D·mL的菌液對應的菌體沉淀,完成圖≥50O D·mL的菌液對應的菌體沉淀;D·mL=OD600的值*菌液體積

將裝有菌體沉淀的離心管在干冰/冰袋條件下寄送,或是暫時存放于-80℃后再干冰/冰袋寄送。另送1-2份樣品備份;

樣品類型:DNA

送樣要求樣品量:掃描圖DNA總量≥1μg,濃度≥20ng/μL,完成圖DNA總量≥1μg,濃度≥20ng/μL;

DNA質(zhì)量:OD260/280=1.8-2.0,OD260/230=1.8-2.2;DNA的主峰帶明顯且在2kb以上,無明顯RNA污染;

為了避免DNA樣品的降解,寄送過程中務必保證足夠的干冰/冰袋,避免樣品反復凍融,送樣時注明溶劑組分;

注:老師在拿到DNA膠圖后,如不確定樣品是否合格,可在送樣之前先將膠圖發(fā)送到mdna@majorbio.com,由技術人員評估確認后再進行樣品寄送;病原微生物只接受DNA樣本。



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